文献解读单细胞测序研究膀胱癌中癌症相关成 [复制链接]

原文名称：Single-cellRNAsequencinghighlightstheroleofinflammatorycancer-associatedfibroblastsinbladderurothelialcarcinoma

发表杂志：NatureCommunications

影响因子：12.

膀胱癌(BC)是世界上最普遍的泌尿生殖系统恶性肿瘤之一。目前人们尽管在癌症生物学和治疗方面取得了实质性进展，但膀胱癌患者的临床结果仍不令人满意。肿瘤微环境(TME)是能够发现治疗靶点的一个重要研究方向，然而BC是免疫浸润最少的癌症之一，这可能是对抗PD1治疗反应不佳的原因。因此，对膀胱癌免疫方向的研究以及未来药物的发展成为了当务之急。

研究人员选取了来自膀胱尿路上皮癌或瘤旁黏膜样本的个单细胞的转录组数据进行分析，并生成了膀胱癌组织内整个TME的图谱。同时研究人员发现了治疗膀胱癌的可能性靶点，为膀胱癌的个体化治疗提供了理论依据。

结论

1.细胞亚群聚类

2.上皮细胞亚群分析

研究人员进一步将上皮细胞分成了17个亚群。为了发现肿瘤患者上皮细胞的特异表达模式，研究人员通过InferCNV分析又将上皮细胞分为4组：正常对照组、低CNV组、高CNV组、和未检测到CNV组。同时，研究人员发现一些基因在对照组和CNV未检测组中表达，但在肿瘤细胞（高CNV组）中几乎不表达，这些基因主要富集在免疫相关通路，特别是B细胞相关通路中。结果表明，膀胱癌细胞可能通过下调免疫原性来逃避免疫检测。

3.髓系细胞亚群分析

研究人员将髓系细胞分成了7个亚群，肿瘤相关巨噬细胞（TAM，MRC1+C1高）；CD1C+树突状细胞（CD1C+DCs、CD1C+CLEC10A+）；单核细胞（SA8+SA9+）；增殖的骨髓细胞（TOP2A+）；交叉呈递DC(CLEC9A+)；滤泡B细胞(CD79A+MS4A1+)；和LAMP3+DCs(LAMP3+CCR7+)。分析可得单核细胞主要来源于正常粘膜组织，而肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在膀胱癌组织中富集。同时，通过拟时序分析研究人员发现肿瘤区域的单核细胞被重编程为TAMs细胞。这些结果为改变免疫微环境的形成提供了潜在的靶点。

4、成纤维细胞亚群分析

成纤维细胞(COL1A1+)分为两种不同类型：PDGFRA+成纤维细胞表现出多种细胞因子和趋化因子的强烈表达。强调了一种癌症相关成纤维细胞(CAF)亚群，即炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAFs)在BC中的作用，并发现了BC治疗的可能治疗靶点。此外，研究人员通过将scRNA-seq数据与公共数据集中的多个批量RNA测序或微阵列图谱相关联来研究TME和BC分子亚型之间的关系。这些结果促进了对患者间异质性的认识，为膀胱尿路上皮癌的个体化治疗提供了依据。

参考文献/p>

ChenZ,ZhouL,LiuL,HouY,XiongM,YangY,HuJ,ChenK.Single-cellRNAsequencinghighlightstheroleofinflammatorycancer-associatedfibroblastsinbladderurothelialcarcinoma.NatCommun.Oct8;11(1):.doi:10./s---5.PMID:;PMCIDMC.

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本文为伯豪生物原创

撰稿人：王雨诺

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